中国计算机学会青年计算机科技论坛济南分论坛
CCF Young Computer Scientists & Engineers Forum
CCF YOCSEF济南
于2014年6月7日(星期六)14:30-17:20
在济南市南辛庄西路336号济南大学信息科学与工程学院举行
学术报告会，敬请光临
报告会主题
智能计算与生物大数据
程 序
14:10 签到
第一阶段：（14:30-15:10）2014 CCF YOCSEF济南分论坛换届仪式
第二阶段：(15:20-17:20)学术报告会
特邀讲者：陈志 教授 青海师范大学生命与地理科学学院
演讲题目：高原鼠兔血红蛋白DNA序列与进化
特邀讲者：张群业 教授 山东大学齐鲁医院
演讲题目：大数据时代的生物医学数据
执行主席：马炳先 博士 济南大学 CCF YOCSEF济南分论坛主席
执行主席：王 栋 博士 济南大学 CCF YOCSEF济南分论坛委员
智能计算与生物大数据
近二十年来，生命科学伴随高通量测序技术的更新换代以及生物芯片等技术的广泛应用，积累了海量的生命科学信息数据。但数据本身的复杂性及相应信息处理方法的缺乏掩盖了隐藏在数据背后的生命现象本质，“数据丰富，知识贫乏”成为制约学术界和工业界相关领域的瓶颈问题。如何利用表示、处理和分析海量的复杂生命数据，揭示其背后的生命科学规律，从而进行疾病诊断、新药开发等，成为大数据背景下信息科学与生命科学前沿领域的重要挑战性课题。
本次学术报告会将以稀有野生动植物资源、重大疾病临床数据为例，围绕大数据背景下如何运用智能计算手段，进行生物多样性信息数据的获取、处理，进而揭示生命规律本质等方面展开深入讨论。
特约讲者：陈志，男，博士，教授，博士生导师。现为青海师范大学生命与地理科学学院院长，青海省野生动植物保护协会常务理事，青海省西宁市科技特派员专家咨询团成员，青海省西宁市工业项目专家咨询组成员。共主持国家科技支撑课题、“973前期”、“948”、国家重大科技专项、农业成果转化、青海省科研课题等40余项。目前主持项目6项，其中国家科技部项目1项，国家农业部项目1项，教育部项目1项，省级项目1项；参加项目 6项，其中国家科技部1项，国家检验检疫总局1项，省级2项。参编著作2部，发表论文30余篇，获省级成果4项。国家发明专利2项，获省级成果6项，西宁市科技进步三等奖1项。
报告提要：高原鼠兔(Ochotona curzoniae) 是世代繁衍、生存在青藏高原的高原适应性哺乳动物，在长时间的低氧条件选择下，进化出一套适应高原高海拔高寒低氧的特殊形态、生理、基因、遗传等机制。血红蛋白为特定基因的产物, 并在其分子结构的不同水平上显示出物种或个体差异性。血红蛋白与氧的结合是生物体摄取氧气的第一环节, 是同外界氧气首先发生相互作用的步骤, 同时也是将氧传送到机体各部位的介质, 其氧结合特征对动物的低氧抵抗能力起重要的生理作用。大量研究提示，长期生活在在高原的动物种类已经发展和进化出一套有利的血红蛋白适应机制，这种适应机制是可通过遗传信息编码“烙印”在动物个体的基因序列中。我们利用分子生物学及生物信息学手段，克隆并证实高原鼠兔血红蛋白DNA序列，利用智能计算算法，通过进化树比较，找到了序列中有可能控制其适应低氧生存的关键区域片段。
特约讲者 张群业，男，教授，博士生导师。2001.7硕士毕业于山东大学医学院生物化学与分子生物学专业，2004.7博士毕业于上海第二医科大学遗传学专业。之后在上海血液学研究所、医学基因组学国家重点实验室工作。在陈竺、陈赛娟和王振义三位院士指导下，相继作为学术骨干分别参与了我国蛋白质组学和系统生物学领域的首个973项目，并作为课题负责人承担973项目子课题，从事功能基因组学、系统生物学和大规模组学数据分析的研究。于2009年在山东大学齐鲁医院教育部和卫生部心血管重构与功能研究重点实验室工作，在张运院士指导下，从事心血管和肿瘤等复杂疾病的基因组学、蛋白组学和系统生物学的研究。于2010年获“教育部新世纪优秀人才项目”支持。目前已在PNAS、MolCell Proteomics、J Proteome Res和JCEM国内外杂志发表论文19篇，已累计被引用500余次。
报告提要 以第二代测序技术为代表的高通量生物技术快速发展，使得各种基础实验研究数据呈现爆炸性增长的趋势，海量的数据不断产生。同时，随着临床数据采集、存储、管理和应用相关的医疗信息技术的发展，临床数据也迅速积累。另外，每年生物医学领域发表海量的以自然语言为基础的研究文献。一个基本的事实就是：生物医学研究产出海量数据的时间迅速缩短，成本快速降低，生物医学研究已经和数据科学与信息科学变得越来越密不可分，跨入了大数据时代。在这个报告中，我们将介绍生物医学研究领域大数据的主要来源、类型、特点和格式；医学基础研究与临床工作者对大数据处理的需求；以及目前分析最常见生物医学大数据时常用的软件和工具。并将通过我们实际进行的两个研究实例来展示说明上述问题。
参加人员：IT领域专业人士、研究生、媒体、其他有兴趣者
报名方式：Email：zhuav@163.com; Tel: 15963138611
报告会地点：济南市南辛庄西路336号济南大学信息学院(十二教学楼)703会议室（下图A处）
京公网安备 11010802032778号
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